اتخذ المجلس العسكري في مدينة الكسوة عدة قرارات هامة وأمور تنظيمية نحو تنظيم العمل المؤسساتي في المدينة وبالأخص بالقسم المحرر منها والواقع تحت سيطرة الجيش الحر وفصائله التي من أهمها لواء الحق ولواء الزبير ابن العوام وبيارق الشام :
حيث قام المجلس بانتداب قيادة جديدة له لتحسين البنية التنظيمية وذلك بهدف تحسين العمل المؤسساتي بشكل يلبي طموحات الناس .
كذلك قام المجلس وبعد مشاورات مطولة باتخاذ الآتي :
أصدر قرار منع بموجبه اتخاذ مقرات أو مراكز لهيئات عسكرية مجهولة , بالإضافة لمنع ممارسة أية نشطات في المنطقة دون التنسيق مع المجلس العسكري في المدينة مهددين من يخالف الأوامر بالاعتقال والحاسبة .
كما داع المجلس العسكري في خاتم بيانه كل من لا ينضوي تحت المجلس العسكري إلى التعاون معه والتنسيق في كل الأمور نحو تحقيق الوحدة المرجوة وحتى تكون المعارضة كلا واحدا بمواجهة النظام.